Klooridioksidi on erittäin epästabiili ja reaktiivinen kaasu, jolla on desinfioiva vaikutus, koska se hajottaa (hapettaa) bakteerien, sienien, virusten jne. solukalvoja.
Klooridioksidi hajoaa auringonvalossa erittäin nopeasti ja jättää jälkeensä vain happea ja suolaa (ruokasuolaa).